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140 questions
🇫🇷 | 🇫🇷 |
Glutaraldéhyde dihydroxyacétone | Phosphorylables en C3 --> glycolyse Peuvent former des dérivés ester phosphoriques |
D-érythrose | Phosphorylable en C4 --> cycle des pentoses |
D-ribose | Présent dans nucléotides, nucléosides, ARN |
2-déosxyribose | Présent dans l'ADN |
D-arabinose | Précurseur du D-glucose et du D-mannose |
L-arabinose | Non métabolisé par l'Homme --> élimination par voie urinaire Très présent dans les plantes et les fruits Pentose alimentaire physiologique |
D-ribulose | Interconversion : D-ribose et D-arabinose Phosphorylable en 5 ou 1/5 --> cycle des pentoses |
D-xylose | Rien à savoir ! |
Α-D-glucose | Phosphorylable en 1 ou 6 |
Α-D-mannose | Phosphorylable en 6 |
Α-D-galactose | Phosphorylable |
Β-L-fucose | 6-désoxy-L-galactose Un des 2 seuls oses de série L présents dans l'organisme |
D-fructose | Phosphorylable en 6 ou 1/6 Présent dans le métabolisme intermédiaire |
Sedoheptulose | Présent dans le cycle des pentoses |
D-glucosamine | 2-amino-2-désoxy-D-glucose |
N-acétyl-neuramique (9C) = acide sialique = NANA | Présent dans les gangliosides |
Acide muramique | Présent dans la paroi bactérienne |
Acide D-glucuronique | Détoxification : se conjugue aux toxiques endogènes ou exogènes, puis leur élimination urinaire |
Sorbitol mannol inositol (glycérophospholipide) | Cyclitols : polyols cycliques SANS fonction pseudo-aldéhydique |
Glycine PAS DE C* : PAS DE SERIE Coudes et Boucles | Inhibiteur du SNC Précurseur de : porphyrine (GR), créatine (foie), glutathion (tripeptide E-C-G) |
Alanine hélices α +++ β-ALA : vitamine B5 +++ | Cycle du muscle : GLU + pyruvate ↔ α-cétoglutarate + ALA (via transamination grâce à l'ALAT) Cycle de Felig = Foie : α-cétoglutarate + ALA ↔ GLU + pyruvate qui devient du glucose qui va être utilisé par le muscle et devenir du pyruvate et ainsi de suite |
Valine feuillets β +++ | Rien d'autre à savoir ! |
Leucine hélice α +++ feuillets β +++ | Rien d'autre à savoir ! |
Isoleucine hélice α +++ feuillets β +++ | Rien d'autre à savoir ! |
INFORMATIONS IMPORTANTES | Je n'ai pas précisé le nom des chaînes carbonées, ni la polarité, ni les fonctions : ce sont des bases (bah non pas toutes mdr) qu'il faut connaître avant de s'attaquer aux flashcards, comme ça c'est plus synthétique et on optimise la révision ! |
Proline Coudes et boucles +++ cycle pyrrolidique | Incapacité à faire des liaisons H --> déstαbilisαtion des hélices α et βirfucation des feuillets β Modif post-trad : hydroxylation en 4 : VOIR SCORBUT, A CONNAITRE !!! |
Phénylalanine Noyau benzène | VOIR CATECHOLAMINES, A CONNAITRE !!! |
Tryptophane Noyau indole = benzène + pyrrole | Précurseur de : NAD (via kynurénine), Sérotonine (NT du bonheur), précurseur de Mélatonine (hormone du sommeil) |
Tyrosine Noyau phénol feuillets β +++ | VOIR CATECHOLAMINES, A CONNAITRE !!! |
Sérine | Modif post-trad : phosphorylation (kinases) et O-glycosylation (Golgi) En protéine : participe aux liaisons H |
Thréonine | Modif post-trad : phosphorylation (kinases) et O-glycosylation (Golgi) En protéine : participe aux liaisons H |
Cystéine Feuillets β ++ | Deux cystéines (pas forcément à côté dans la chaîne) peuvent former un pont disulfure entre elles pour former une cystine |
Méthionine hélices α ++ | - Précurseur de la cystéine - Précurseur de SAM (S-adénosyl-MET) - Codé par AUG : codon-start, puis clivé la plupart du temps par une MET-aminopeptidase |
Aspartate hélices α ++ | Métabolite du cycle de l'urée Rôle dans la néoglucogénèse Fait des liaisons H en protéine pHi <<< |
Glutamate hélice α ++ | - NT excitateur du SNC - Précurseur de : l'acide γ-carboxyglutamique (augmente fixation Ca2+ → coagulation) et l'acide γ-aminobutyrique (GABA) NT inhibiteur du SNC - La balance entre GABA et E est cruciale, si trop de E → épilepsie, ischémie cérébrale - Fait des liaisons H en protéine |
Asparagine | MPT : N-glycosylation (RE puis Golgi) → rôle dans l'adressage des protéines |
Glutamine Etat libre ++++ hélices α ++ | Donneur de N pour la biosynthèse d'AA et de bases Détoxification du muscle après l'effort (élimine l'ammoniac) Forme de transport et de détoxification de l'ammoniac Précurseur de la citrulline dans le cycle de l'urée |
Lysine hélices α +++ | MPT : - Hydroxylation (via lysyl-hydroxylase : mêmes besoins que prolyl-hydroxylase)→ hydroxylysine (collagène) - Méthylation : modifie l'activité - Acétylation : modifie l'activité - Sumoylation : modifie l'activité - Ubiquitination : signe de dégradation protéique |
Arginine | - Précurseur de : NO (oxyde nitrique) NT et vasodilatateur ; Créatine : stockée sous forme de P-créatine, synthétisé dans le foie, ressource énergétique des muscles ; Homocystéine - Dérive de la citrulline, précurseur de l'ornithine (cycle de l'urée dans le foie) MPT : méthylation |
Histidine | - Précurseur de l'histamine : déclencheur d'allergies, régulation de l'acidité gastrique - Liaisons avec des ions métalliques bivalents : Fe2+, Zn2+, Ni2+ - Fait des liaisons H en protéine |
Sélénocystéine | - Dérive de la sérine (pas de la cystéine) : substitution du O par Se - Codé par UGA - Introduction en cours de synthèse dans des sélénoprotéines : utile comme glutathion peroxydase et désiodase (cf hormones thyroïdiennes) |
Pyrrolysine | - Dérive de la lysine - Codé par UAG - Uniquement chez les archéobactéries - Structure des méthanogènes |
Saccharose NON REDUCTEUR | Sucre de la betterave α-D-glucose (1➔2) β-D-fructose (⚠cétose !) |
Tréhalose NON REDUCTEUR | Présent dans les champignons et les insectes α-D-glucose (1➔1) α-D-glucose |
Maltose réducteur | Dans l'intestin : issu de l'amidon ou du glycogène Dans la nature : chaise avec LH latérale Chaînon de base de l'amidon α-D-glucose (1→4) D-glucose |
Iso-Maltose réducteur | Dans l'intestin : issu de l'amidon ou du glycogène α-D-glucose (1→6) D-glucose (pas de LH !) |
Cellobiose réducteur | Produit de la dégradation de la cellulose NON METABOLISEE PAR L'HOMME : pas de β-glucosidase chez l'Homme ! LH entre OH (C3) et O hétérocyclique → Structure très régulière (double chaise) → Fibres qui s'empilent facilement → Transit intestinal animal ++ |
Lactose Réducteur | Β-D-galactose (1→4) D-glucose LACTASE (= β-galactosidase) Enzyme responsable de la digestion du lait Présente chez le bébé mais plus chez l'adulte (naturellement) Consommation poursuivie → Production forcée Déficitaire pour les 2/3 de la population → intolérance au lactose |
Raffinose TRIholoside NON REDUCTEUR | Présent dans la canne à sucre et la betterave α-galactose (1→6) α-glucose (1→2) β-fructose |
D-glucosamine | 2-amino-2-désoxy-D-glucose |
N-acétyl-neuramique (9C) = acide sialique = NANA | Présent dans les gangliosides |
Acide muramique | Présent dans la paroi bactérienne |
Acide D-glucuronique | Détoxification : se conjugue aux toxiques endogènes ou exogènes, qui seront éliminés par voie urinaire |
Sorbitol Mannol Inositol (glycérophospholipide) | Cyclitols : polyols cycliques SANS fonction pseudo-aldéhydique |
N-acétylglucosamine N-acétylgalactosamine | Participent à la formation de glycoprotéines et glycolipides |
Amidon HOMOpolyoside | Réserve glucidique du monde végétal Mélange de deux homopolymères : Amylose (20%) et Amylopectine (80%) Insoluble dans l'eau froide mais pas dans l'eau chaude Amidon + iode = bleu |
Amylose 20% de l'amidon | Chaîne linéaire de D-glucoses α(1→4) UNE SEULE extrémité réductrice 200 à 3000 D-glucoses/molécule qui peuvent se stabiliser par des LH → structure compacte Dans l'eau : structure hélicoïdale avec des LH |
Amylopectine (= Iso-Amylose) 80% de l'amidon | Polysaccharide avec des chaînes linéaires α(1→4) et latérales α(1→6) Chaîne latérale : 20-25 résidus de glucose Structure arborescente UNE SEULE extrémité réductrice Plusieurs enzymes nécessaires pour en libérer du glucose |
Glycogène | Stockage du glucose dans le foie et les muscles : 30k glucoses/glycogène Comme l'amylopectine mais PLUS ramifié (plus de α(1→6) (tous les 8-12 résidus)) Plus compact que l'amidon. Glycogène + Iode = brun UNE SEULE extrémité réductrice (liée avec la glycogénine) |
Cellulose (propriétés) | Enchaînement de cellobioses → Non digérée par l'Homme (pas de β-glucosidase) : fibres alimentaires qui ne nourrissent pas mais augmentent le bol alimentaire → Organisée en microfibrilles (chaînes parallèles stabilisées par des LH) PLUSIEURS extrémités réductrices 98% du coton, 50% bois/paille |
Cellulose (fonctions) | - Fibres alimentaires insolubles dans l'eau (cellulose, lignine) → Pas de digestion mais transit intestinal +++ - Fibres alimentaires solubles dans l'eau : pectines (acides α-D-galacturonique) : gels visqueux et inuline (fructoses + 1 glucose) : gestion du diabète, ↘ du taux de cholestérol, agent prébiotique (flore intestinale +++), prévention du cancer du colon, utilisé pour mesurer le débit de filtration glomérulaire |
Acide hyaluronique (AH) GAG de structure | Unité élémentaire (liées β(1→4)) : acide D-glucuronique β(1→3) N-acétyl-D-glucosamine = acide hyalobiuronique Viscosité ++++, charge - : attirent les Na+ Molécule fondamentale de la MEC : rôle de ciment intercellulaire, hydratation des tissus, lubrifiant des articulations hyaluronidase : permet donc l'entrée de produits étrangers, comme le spz dans la ZP |
Chondroïtine (propriétés) GAG de structure | Unité élémentaire (liées β(1→4)) : acide D-glucuronique β(1→3) N-acétyl-D-galactosamine = chondrosine NaDg : sulfatée en 4 (forme A) ou 6 (forme C) Moins visqueux que l'AH mais rétention d'eau importante Nombreuses charges - : fixation de Ca2+ |
Chondroïtine (fonctions) GAG de structure | Fixation de Ca2+ → ossification + cartilage Association au collagène Rôle dans l'arthrose : hydratation du cartilage + protection → chondroprotecteur Chondroïtines sulfates unies par des liaisons covalentes (O-glycosidique) à des séryl ou thréonyl par l'intermédiaire de 3 oses neutres (Xyl-Gal-Gal) → formation de protéoglycannes |
Dermatane sulfate GAG de structure | Présent dans la peau, les os, les tendons Peut être associé aux chondroïtines sulfates au niveau du cartilage ou de la peau |
Kératane sulfate GAG de structure | Présent dans les cartilages costaux et les disques intervertébraux |
Héparine GAG de sécrétion | Disaccharide le plus chargé : plusieurs groupements sulfates Sécrétée par des mastocytes Propriétés anticoagulantes |
Mucoïtine-sulfate GAG de sécrétion | Présent dans le mucus de sécrétion des glandes du tube digestif et de l'appareil respiratoire |
Echantillons pour la coupe en paraffine | Uniquement les coupes (c'est dans le nom) |
Fixateurs de la coupe en paraffine | Méthanol, éthanol Mélange méthanol + acide acétique Formol Liquide de Boin : formol + acide picrique |
Etapes de l'inclusion de la coupe en paraffine | - Déshydratation (bains d'alcool 70/95/100°) - Solvant du milieu d'inclusion : TOLUENE - Milieu d'inclusion : Paraffine (57/60°) ou Paraplast (50°) |
Coupe de l'échantillon inclus en paraffine | - Coupes en ruban de 3 à 5 μm avec un microtome à avance mécanique - Dépôt sur une lame de verre pré-gélatinée + goutte d'eau - Séchage sur platine chauffante à 37° |
Colorations topographiques pour la coupe en paraffine | - H, HE, HES - Trichrome de Masson - MGG : sang - Papanicolaou : frottis - Imprégnation argentique : architecture du TN - Crésyl violet : neurones |
Colorations signalétiques des composants cellulaires pour la coupe en paraffine | - PAS : mucine, glycogène, glycoprotéines - Tétrachrome d'Herlant-Racadot : glycoprotéines de cellules hypophysaires |
Colorations signalétiques des composants tissulaires pour la coupe en paraffine | - PAS : membrane basale - Imprégnation argentique : fibres de réticuline - Fuchsine résorcine ou orcéine : fibres élastiques |
Montage non aqueux de la coupe en paraffine | - Déshydratation avec des bains d'alcool (70/95/100°) - Solvant - résine + lamelle |
Montage aqueux de la coupe en paraffine | - Glycérine + agent de conservation - Pose de lamelle |
Echantillons pour la congélation in vivo | Tout mais pas de cellules vivantes |
Fixateurs de la congélation in vivo | Méthanol, éthanol Mélange méthanol + acide acétique Formaldéhyde ou paraformaldéhyde PAS DE LIQUIDE DE BOIN |
Etapes de l'enrobage pour la coupe en congélation | - Echantillon mis dans une cryoprotecteur - Bain d'isopentane à -80° - Bain d'azote liquide à -196° |
Coupe de l'échantillon congelé in vivo | - Coupes de 20 μm PAS EN RUBAN avec le cryostat rotatif à avance mécanique dans une enceinte à -20° - Dépôt sur une lame de verre pré-gélatinée puis séchage à T° ambiante - Stockage à -80° |
Colorations topographiques d'une coupe en congélation | - HES ou TM - Crésyl violet - Thionine - Bleu de toluidine, bleu de méthylène |
Colorations signalétiques pour une coupe en congélation in vivo | - Les classiques (PAS, orcéine ou FR, imprégnation argentique) - Mise en évidence des lipides : Oil red O/Noir Soudan/Bleu de Nil |
Montage d'une coupe en congélation in vivo | Montage aqueux car un montage non aqueux dissout les lipides (à cause de l'alcool) |
Echantillons pour un examen en extemporané | PAS de cellules vivantes, ni autopsie, ni pièces opératoires après chirurgie |
Fixation pour un examen en extemporané | PAS de fixation (gain de temps !) |
Inclusion pour un examen en extemporané | Enrobage comme pour la coupe en congélation : - Cryoprotecteur - Bain d'isopentane à -80° - Bain de N2 à -196° |
Coupe pour un examen en extemporané | Pareil que pour la coupe en congélation - Cryostat rotatif à avance mécanique, enceinte à -20°, 20 μm - Dépôt sur une lame de verre pré-gélatinée, séchage à T° ambiante - Stockage à -80° |
Colorations topographiques pour un examen en extemporané | Pareil que pour la coupe en congélation - HES ou TM - Crésyl violet, thionine - Bleu de toluidine, Bleu de méthylène |
Colorations signalétiques pour un examen en extemporané | Pareil que pour la coupe en congélation - Les classiques : PAS, orcéine ou FR, imprégnation argentique - Mise en évidence des lipides : Oil red O/Noir Soudan/Bleu de Nil |
Montage pour un examen en extemporané | Montage très succinct, aqueux ou à sec |
Echantillons pour une coupe en résine en ME | Toute forme d'échantillons hospitaliers en coupe |
Fixateurs pour une coupe en résine en ME | - Glutaraldéhyde - Osmium ou acide osmique ou OsO4 - Mélange glutaraldéhyde + osmium + paraformaldéhyde |
Etapes d'inclusion pour une coupe en résine en ME | - Déshydratation avec des bains d'alcool (70/95/100°) - Bains de solvant = oxyde de propylène - Inclusion dans la résine Epoxy, Araldite, Epon à 60° |
Coupe d'un échantillon inclus en résine | - Ultramicrotome à avance thermique : coupes de 50 à 100 nm - Les coupes flottantes sont placées sur la grille de nickel ou d'or pour l'analyse in situ et de cuivre pour la morphologie |
Coloration pour une coupe en résine en ME | PAS de coloration mais CONTRASTE après avoir enlevé la résine - Citrate de plomb : membrane - Acétate d'uranyle : acides nucléiques |
Montage pour une coupe en résine en ME | PAS de montage |
Différentes techniques des études in situ des constituants biochimiques | - Histochimie sur des coupes en paraffine ou en congélation - Histoenzymologie en extemporané ou congelé, ou sur des cellules vivantes issues de cultures in vitro |
Différentes techniques des analyses moléculaires in situ | - Immunocytohistologie en MO et en ME : marquage direct sur l'anticorps primaire ou indirect sur l'anticorps secondaire - Hybridation in situ en MO et en ME |