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LYON SUD

Différents cours de P1 pour les <=LS=> et <=LN=> les civils vous pouvez allez graille vos morts


🇫🇷
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LYON SUD


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Dio Brando


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glutaraldéhyde dihydroxyacétone
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Phosphorylables en C3 --> glycolyse Peuvent former des dérivés ester phosphoriques

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LYON SUD - Details

Levels:

Questions:

140 questions
🇫🇷🇫🇷
Glutaraldéhyde dihydroxyacétone
Phosphorylables en C3 --> glycolyse Peuvent former des dérivés ester phosphoriques
D-érythrose
Phosphorylable en C4 --> cycle des pentoses
D-ribose
Présent dans nucléotides, nucléosides, ARN
2-déosxyribose
Présent dans l'ADN
D-arabinose
Précurseur du D-glucose et du D-mannose
L-arabinose
Non métabolisé par l'Homme --> élimination par voie urinaire Très présent dans les plantes et les fruits Pentose alimentaire physiologique
D-ribulose
Interconversion : D-ribose et D-arabinose Phosphorylable en 5 ou 1/5 --> cycle des pentoses
D-xylose
Rien à savoir !
Α-D-glucose
Phosphorylable en 1 ou 6
Α-D-mannose
Phosphorylable en 6
Α-D-galactose
Phosphorylable
Β-L-fucose
6-désoxy-L-galactose Un des 2 seuls oses de série L présents dans l'organisme
D-fructose
Phosphorylable en 6 ou 1/6 Présent dans le métabolisme intermédiaire
Sedoheptulose
Présent dans le cycle des pentoses
D-glucosamine
2-amino-2-désoxy-D-glucose
Acide muramique
Présent dans la paroi bactérienne
Acide D-glucuronique
Détoxification : se conjugue aux toxiques endogènes ou exogènes, puis leur élimination urinaire
Sorbitol mannol inositol (glycérophospholipide)
Cyclitols : polyols cycliques SANS fonction pseudo-aldéhydique
Glycine PAS DE C* : PAS DE SERIE Coudes et Boucles
Inhibiteur du SNC Précurseur de : porphyrine (GR), créatine (foie), glutathion (tripeptide E-C-G)
Alanine hélices α +++ β-ALA : vitamine B5 +++
Cycle du muscle : GLU + pyruvate ↔ α-cétoglutarate + ALA (via transamination grâce à l'ALAT) Cycle de Felig = Foie : α-cétoglutarate + ALA ↔ GLU + pyruvate qui devient du glucose qui va être utilisé par le muscle et devenir du pyruvate et ainsi de suite
Valine feuillets β +++
Rien d'autre à savoir !
INFORMATIONS IMPORTANTES
Je n'ai pas précisé le nom des chaînes carbonées, ni la polarité, ni les fonctions : ce sont des bases (bah non pas toutes mdr) qu'il faut connaître avant de s'attaquer aux flashcards, comme ça c'est plus synthétique et on optimise la révision !
Proline Coudes et boucles +++ cycle pyrrolidique
Incapacité à faire des liaisons H --> déstαbilisαtion des hélices α et βirfucation des feuillets β Modif post-trad : hydroxylation en 4 : VOIR SCORBUT, A CONNAITRE !!!
Phénylalanine Noyau benzène
VOIR CATECHOLAMINES, A CONNAITRE !!!
Tryptophane Noyau indole = benzène + pyrrole
Précurseur de : NAD (via kynurénine), Sérotonine (NT du bonheur), précurseur de Mélatonine (hormone du sommeil)
Tyrosine Noyau phénol feuillets β +++
VOIR CATECHOLAMINES, A CONNAITRE !!!
Sérine
Modif post-trad : phosphorylation (kinases) et O-glycosylation (Golgi) En protéine : participe aux liaisons H
Thréonine
Modif post-trad : phosphorylation (kinases) et O-glycosylation (Golgi) En protéine : participe aux liaisons H
Cystéine Feuillets β ++
Deux cystéines (pas forcément à côté dans la chaîne) peuvent former un pont disulfure entre elles pour former une cystine
Méthionine hélices α ++
- Précurseur de la cystéine - Précurseur de SAM (S-adénosyl-MET) - Codé par AUG : codon-start, puis clivé la plupart du temps par une MET-aminopeptidase
Aspartate hélices α ++
Métabolite du cycle de l'urée Rôle dans la néoglucogénèse Fait des liaisons H en protéine pHi <<<
Glutamate hélice α ++
- NT excitateur du SNC - Précurseur de : l'acide γ-carboxyglutamique (augmente fixation Ca2+ → coagulation) et l'acide γ-aminobutyrique (GABA) NT inhibiteur du SNC - La balance entre GABA et E est cruciale, si trop de E → épilepsie, ischémie cérébrale - Fait des liaisons H en protéine
Asparagine
MPT : N-glycosylation (RE puis Golgi) → rôle dans l'adressage des protéines
Glutamine Etat libre ++++ hélices α ++
Donneur de N pour la biosynthèse d'AA et de bases Détoxification du muscle après l'effort (élimine l'ammoniac) Forme de transport et de détoxification de l'ammoniac Précurseur de la citrulline dans le cycle de l'urée
Lysine hélices α +++
MPT : - Hydroxylation (via lysyl-hydroxylase : mêmes besoins que prolyl-hydroxylase)→ hydroxylysine (collagène) - Méthylation : modifie l'activité - Acétylation : modifie l'activité - Sumoylation : modifie l'activité - Ubiquitination : signe de dégradation protéique
Arginine
- Précurseur de : NO (oxyde nitrique) NT et vasodilatateur ; Créatine : stockée sous forme de P-créatine, synthétisé dans le foie, ressource énergétique des muscles ; Homocystéine - Dérive de la citrulline, précurseur de l'ornithine (cycle de l'urée dans le foie) MPT : méthylation
Histidine
- Précurseur de l'histamine : déclencheur d'allergies, régulation de l'acidité gastrique - Liaisons avec des ions métalliques bivalents : Fe2+, Zn2+, Ni2+ - Fait des liaisons H en protéine
Sélénocystéine
- Dérive de la sérine (pas de la cystéine) : substitution du O par Se - Codé par UGA - Introduction en cours de synthèse dans des sélénoprotéines : utile comme glutathion peroxydase et désiodase (cf hormones thyroïdiennes)
Pyrrolysine
- Dérive de la lysine - Codé par UAG - Uniquement chez les archéobactéries - Structure des méthanogènes
Saccharose NON REDUCTEUR
Sucre de la betterave α-D-glucose (1➔2) β-D-fructose (⚠cétose !)
Tréhalose NON REDUCTEUR
Présent dans les champignons et les insectes α-D-glucose (1➔1) α-D-glucose
Maltose réducteur
Dans l'intestin : issu de l'amidon ou du glycogène Dans la nature : chaise avec LH latérale Chaînon de base de l'amidon α-D-glucose (1→4) D-glucose
Iso-Maltose réducteur
Dans l'intestin : issu de l'amidon ou du glycogène α-D-glucose (1→6) D-glucose (pas de LH !)
Cellobiose réducteur
Produit de la dégradation de la cellulose NON METABOLISEE PAR L'HOMME : pas de β-glucosidase chez l'Homme ! LH entre OH (C3) et O hétérocyclique → Structure très régulière (double chaise) → Fibres qui s'empilent facilement → Transit intestinal animal ++
Lactose Réducteur
Β-D-galactose (1→4) D-glucose LACTASE (= β-galactosidase) Enzyme responsable de la digestion du lait Présente chez le bébé mais plus chez l'adulte (naturellement) Consommation poursuivie → Production forcée Déficitaire pour les 2/3 de la population → intolérance au lactose
Raffinose TRIholoside NON REDUCTEUR
Présent dans la canne à sucre et la betterave α-galactose (1→6) α-glucose (1→2) β-fructose
D-glucosamine
2-amino-2-désoxy-D-glucose
Acide muramique
Présent dans la paroi bactérienne
Acide D-glucuronique
Détoxification : se conjugue aux toxiques endogènes ou exogènes, qui seront éliminés par voie urinaire
Sorbitol Mannol Inositol (glycérophospholipide)
Cyclitols : polyols cycliques SANS fonction pseudo-aldéhydique
N-acétylglucosamine N-acétylgalactosamine
Participent à la formation de glycoprotéines et glycolipides
Amidon HOMOpolyoside
Réserve glucidique du monde végétal Mélange de deux homopolymères : Amylose (20%) et Amylopectine (80%) Insoluble dans l'eau froide mais pas dans l'eau chaude Amidon + iode = bleu
Amylose 20% de l'amidon
Chaîne linéaire de D-glucoses α(1→4) UNE SEULE extrémité réductrice 200 à 3000 D-glucoses/molécule qui peuvent se stabiliser par des LH → structure compacte Dans l'eau : structure hélicoïdale avec des LH
Amylopectine (= Iso-Amylose) 80% de l'amidon
Polysaccharide avec des chaînes linéaires α(1→4) et latérales α(1→6) Chaîne latérale : 20-25 résidus de glucose Structure arborescente UNE SEULE extrémité réductrice Plusieurs enzymes nécessaires pour en libérer du glucose
Glycogène
Stockage du glucose dans le foie et les muscles : 30k glucoses/glycogène Comme l'amylopectine mais PLUS ramifié (plus de α(1→6) (tous les 8-12 résidus)) Plus compact que l'amidon. Glycogène + Iode = brun UNE SEULE extrémité réductrice (liée avec la glycogénine)
Cellulose (propriétés)
Enchaînement de cellobioses → Non digérée par l'Homme (pas de β-glucosidase) : fibres alimentaires qui ne nourrissent pas mais augmentent le bol alimentaire → Organisée en microfibrilles (chaînes parallèles stabilisées par des LH) PLUSIEURS extrémités réductrices 98% du coton, 50% bois/paille
Cellulose (fonctions)
- Fibres alimentaires insolubles dans l'eau (cellulose, lignine) → Pas de digestion mais transit intestinal +++ - Fibres alimentaires solubles dans l'eau : pectines (acides α-D-galacturonique) : gels visqueux et inuline (fructoses + 1 glucose) : gestion du diabète, ↘ du taux de cholestérol, agent prébiotique (flore intestinale +++), prévention du cancer du colon, utilisé pour mesurer le débit de filtration glomérulaire
Acide hyaluronique (AH) GAG de structure
Unité élémentaire (liées β(1→4)) : acide D-glucuronique β(1→3) N-acétyl-D-glucosamine = acide hyalobiuronique Viscosité ++++, charge - : attirent les Na+ Molécule fondamentale de la MEC : rôle de ciment intercellulaire, hydratation des tissus, lubrifiant des articulations hyaluronidase : permet donc l'entrée de produits étrangers, comme le spz dans la ZP
Chondroïtine (propriétés) GAG de structure
Unité élémentaire (liées β(1→4)) : acide D-glucuronique β(1→3) N-acétyl-D-galactosamine = chondrosine NaDg : sulfatée en 4 (forme A) ou 6 (forme C) Moins visqueux que l'AH mais rétention d'eau importante Nombreuses charges - : fixation de Ca2+
Chondroïtine (fonctions) GAG de structure
Fixation de Ca2+ → ossification + cartilage Association au collagène Rôle dans l'arthrose : hydratation du cartilage + protection → chondroprotecteur Chondroïtines sulfates unies par des liaisons covalentes (O-glycosidique) à des séryl ou thréonyl par l'intermédiaire de 3 oses neutres (Xyl-Gal-Gal) → formation de protéoglycannes
Dermatane sulfate GAG de structure
Présent dans la peau, les os, les tendons Peut être associé aux chondroïtines sulfates au niveau du cartilage ou de la peau
Kératane sulfate GAG de structure
Présent dans les cartilages costaux et les disques intervertébraux
Héparine GAG de sécrétion
Disaccharide le plus chargé : plusieurs groupements sulfates Sécrétée par des mastocytes Propriétés anticoagulantes
Mucoïtine-sulfate GAG de sécrétion
Présent dans le mucus de sécrétion des glandes du tube digestif et de l'appareil respiratoire
Echantillons pour la coupe en paraffine
Uniquement les coupes (c'est dans le nom)
Fixateurs de la coupe en paraffine
Méthanol, éthanol Mélange méthanol + acide acétique Formol Liquide de Boin : formol + acide picrique
Etapes de l'inclusion de la coupe en paraffine
- Déshydratation (bains d'alcool 70/95/100°) - Solvant du milieu d'inclusion : TOLUENE - Milieu d'inclusion : Paraffine (57/60°) ou Paraplast (50°)
Coupe de l'échantillon inclus en paraffine
- Coupes en ruban de 3 à 5 μm avec un microtome à avance mécanique - Dépôt sur une lame de verre pré-gélatinée + goutte d'eau - Séchage sur platine chauffante à 37°
Colorations topographiques pour la coupe en paraffine
- H, HE, HES - Trichrome de Masson - MGG : sang - Papanicolaou : frottis - Imprégnation argentique : architecture du TN - Crésyl violet : neurones
Colorations signalétiques des composants cellulaires pour la coupe en paraffine
- PAS : mucine, glycogène, glycoprotéines - Tétrachrome d'Herlant-Racadot : glycoprotéines de cellules hypophysaires
Colorations signalétiques des composants tissulaires pour la coupe en paraffine
- PAS : membrane basale - Imprégnation argentique : fibres de réticuline - Fuchsine résorcine ou orcéine : fibres élastiques
Montage non aqueux de la coupe en paraffine
- Déshydratation avec des bains d'alcool (70/95/100°) - Solvant - résine + lamelle
Montage aqueux de la coupe en paraffine
- Glycérine + agent de conservation - Pose de lamelle
Echantillons pour la congélation in vivo
Tout mais pas de cellules vivantes
Fixateurs de la congélation in vivo
Méthanol, éthanol Mélange méthanol + acide acétique Formaldéhyde ou paraformaldéhyde PAS DE LIQUIDE DE BOIN
Etapes de l'enrobage pour la coupe en congélation
- Echantillon mis dans une cryoprotecteur - Bain d'isopentane à -80° - Bain d'azote liquide à -196°
Coupe de l'échantillon congelé in vivo
- Coupes de 20 μm PAS EN RUBAN avec le cryostat rotatif à avance mécanique dans une enceinte à -20° - Dépôt sur une lame de verre pré-gélatinée puis séchage à T° ambiante - Stockage à -80°
Colorations topographiques d'une coupe en congélation
- HES ou TM - Crésyl violet - Thionine - Bleu de toluidine, bleu de méthylène
Colorations signalétiques pour une coupe en congélation in vivo
- Les classiques (PAS, orcéine ou FR, imprégnation argentique) - Mise en évidence des lipides : Oil red O/Noir Soudan/Bleu de Nil
Montage d'une coupe en congélation in vivo
Montage aqueux car un montage non aqueux dissout les lipides (à cause de l'alcool)
Echantillons pour un examen en extemporané
PAS de cellules vivantes, ni autopsie, ni pièces opératoires après chirurgie
Fixation pour un examen en extemporané
PAS de fixation (gain de temps !)
Inclusion pour un examen en extemporané
Enrobage comme pour la coupe en congélation : - Cryoprotecteur - Bain d'isopentane à -80° - Bain de N2 à -196°
Coupe pour un examen en extemporané
Pareil que pour la coupe en congélation - Cryostat rotatif à avance mécanique, enceinte à -20°, 20 μm - Dépôt sur une lame de verre pré-gélatinée, séchage à T° ambiante - Stockage à -80°
Colorations topographiques pour un examen en extemporané
Pareil que pour la coupe en congélation - HES ou TM - Crésyl violet, thionine - Bleu de toluidine, Bleu de méthylène
Colorations signalétiques pour un examen en extemporané
Pareil que pour la coupe en congélation - Les classiques : PAS, orcéine ou FR, imprégnation argentique - Mise en évidence des lipides : Oil red O/Noir Soudan/Bleu de Nil
Montage pour un examen en extemporané
Montage très succinct, aqueux ou à sec
Echantillons pour une coupe en résine en ME
Toute forme d'échantillons hospitaliers en coupe
Fixateurs pour une coupe en résine en ME
- Glutaraldéhyde - Osmium ou acide osmique ou OsO4 - Mélange glutaraldéhyde + osmium + paraformaldéhyde
Etapes d'inclusion pour une coupe en résine en ME
- Déshydratation avec des bains d'alcool (70/95/100°) - Bains de solvant = oxyde de propylène - Inclusion dans la résine Epoxy, Araldite, Epon à 60°
Coupe d'un échantillon inclus en résine
- Ultramicrotome à avance thermique : coupes de 50 à 100 nm - Les coupes flottantes sont placées sur la grille de nickel ou d'or pour l'analyse in situ et de cuivre pour la morphologie
Coloration pour une coupe en résine en ME
PAS de coloration mais CONTRASTE après avoir enlevé la résine - Citrate de plomb : membrane - Acétate d'uranyle : acides nucléiques
Différentes techniques des études in situ des constituants biochimiques
- Histochimie sur des coupes en paraffine ou en congélation - Histoenzymologie en extemporané ou congelé, ou sur des cellules vivantes issues de cultures in vitro
Différentes techniques des analyses moléculaires in situ
- Immunocytohistologie en MO et en ME : marquage direct sur l'anticorps primaire ou indirect sur l'anticorps secondaire - Hybridation in situ en MO et en ME